洪涝灾害之后，桐城市多措并举开展洪涝灾害期间卫生防疫工作，确保灾后无大疫。截止到7月25日，桐城市共派出58支卫生应急小分队奔赴灾区，累计消毒面积达1007490平方米。
桐城市启动卫生防疫应急预案，实行灾后疫情监测和疫情报告制度，组建了洪涝灾害卫生应急小分队奔赴灾区，把饮用水消毒措施、药品落实到每户每家，保证供水安全卫生，防止水源性、食源性疾病的发生。对集中式供水强化净化消毒处理，累计向各镇灾民安置点发放消毒片近200箱。对水淹地区和居民住宅、厕所、垃圾点、临时安置点等场所全面实施药物喷洒消毒和卫生处理
